| Özet |
Küresel pandemik koronavirüs hastalığına 2 (Covid-2019) neden olan SARS-CoV-19, yaygın olarak dört yapısal proteinden oluşan ve koronavirüsler olarak bilinen bir virüs ailesine aittir: Spike protein(S), Zarf proteini (E), Zar proteini (M) ve Nükleokapsid proteini (N). SARS-CoV-2 Spike Protein (S Protein), membran füzyonuna ve viral girişe aracılık eden bir glikoproteindir. S proteini homotrimeriktir ve her ~180-kDa monomeri S1 ve S2 olmak üzere iki alt birimden oluşur. SARS-CoV-2'de, çoğu koronavirüste olduğu gibi, aktivasyon için S proteininin iki ayrı peptid olan S1 ve S2 alt birimlerine proteolitik bölünmesi gerekir. S1 alt birimi, proteinin konakçı reseptörüne bağlanmasına odaklanırken, S2 alt birimi hücre füzyonu ile ilgilidir. Yapısal biyoloji çalışmalarına dayalı olarak, S1'in C-terminal bölgesinde yer alan reseptör bağlama alanı (RBD), ya yukarı/ayakta ya da aşağı/yatar durumda yönlendirilebilir. Duran durum, daha yüksek patojenite ile ilişkilidir ve hem SARS-CoV-1 hem de MERS, ilgili RBD'lerindeki esneklik nedeniyle bu duruma erişebilir. Benzer bir iki durumlu yapı ve esneklik, SARS-CoV-2 RBD'de bulunur. Amino asit (aa) dizi homolojisine dayalı olarak, SARS-CoV-2 S1 alt birimi RBD, SARS-CoV-73 S1 RBD'nin RBD'si ile %1 özdeşliğe sahiptir, ancak MERS S22 RBD ile yalnızca %1 homolojiye sahiptir. Düşük aa dizi homolojisi, SARS ve MERS'in farklı hücresel reseptörlere bağlandığı bulgusu ile tutarlıdır. SARS-CoV-2 virüsünün S Proteini, SARS-CoV-1 muadili gibi, Anjiyotensin Dönüştürücü Enzim 2'yi (ACE2) bağlar, ancak çok daha yüksek afinite ve daha hızlı bağlanma kinetiği ile. ACE2 reseptörüne bağlanmadan önce, S1 trimerinin yapısal analizi, trimerik yapıdaki üç RBD alanından sadece birinin "yukarı" konformasyonda olduğunu gösterir. Bu, trimerik alt birimler arasında geçen kararsız ve geçici bir durumdur, ancak yine de antikor tedavisini nötralize etmek için hedeflenen bir maruz kalma durumudur. SARS-CoV-2 proteininin RBD'sine karşı poliklonal antikorların, ACE2 reseptörü ile etkileşimi engellediği ve RBD'nin aşılar veya antiviral tedavi için çekici bir hedef olduğunu doğruladığı gösterilmiştir. Ayrıca, RBD'nin, SARS-CoV-2 virüsüne maruz kaldıktan sonra gelişen bağışıklıkla tutarlı olarak, hastanın kan dolaşımında bulunan nötralize edici antikorların varlığını tespit etmek için kullanılabileceğini gösteren umut verici çalışmalar da var. Son olarak, S Proteininin CD147/EMMPRIN reseptörü yoluyla konakçı hücreleri istila edebileceği ve membran füzyonuna aracılık edebileceği gösterilmiştir. |
